DNA配列解析ソフトウェア『CodonCode Aligner』
DNA 配列のアセンブリとアラインメント
DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、 突然変異の検出に役立つ Windows および macOS 用プログラムです。 親しみやすく分かり易いユーザーインターフェースを備えながら、 Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフル サポートする能力も備えています。
基本情報
CodonCode Aligner 機能一覧 〇インポート／エクスポート ・ABI、AB1、SCF フォーマットのシーケンスクロマトグラフのインポート ・FASTA、FASTQ、Sam、GenBank、EMBL フォーマットのテキストファイルのインポート ・サンプルのサブセットのインポート (例：n 番目ごとのサンプル、プロジェクト内の選択したシーケンスに一致するサンプルのみ等)など 〇シーケンス編集とトリミング ・シーケンスとコンティグのマニュアル編集：サンプルやコンティグエンドの削除、コンティグ分割など 〇シーケンスアセンブリ 〇シーケンスアラインメント 〇シーケンストランスレーション 〇バーチャルクローニング 〇制限マッピング 〇RFLP 分析 〇プライマー設計 〇系統樹 〇突然変異の検出と分析 〇差分表 〇カスタマイズ 〇メチル化分析
価格帯
納期
用途／実績例
【新型コロナウイルスの分析プロセスで CodonCode Aligner を使った論文の例新型コロナウイルスの分析プロセスで CodonCode Aligner を使った論文の例】 ・Emergence of two distinct variants of SARS-CoV-2 and an explosive second wave of COVID-19: the experience of a tertiary care hospital in Pune, India / 9 Jan, 2022, / By Shubham Shrivastava et al. / Archives of Virology （SARS-CoV-2 の 2 つの異なる亜種の出現と COVID-19 の爆発的な第 2 波：インド、プネの 3 次医療病院での経験から） 詳細は下記をご参照ください。 https://www.hulinks.co.jp/software/chem/aligner/section04
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