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DNA 配列のアセンブリとアラインメント

CodonCode Aligner 機能一覧 〇インポート／エクスポート 　・ABI、AB1、SCF フォーマットのシーケンスクロマトグラフのインポート 　・FASTA、FASTQ、Sam、GenBank、EMBL フォーマットのテキストファイルのインポート 　・サンプルのサブセットのインポート 〇シーケンス編集とトリミング 　・シーケンスとコンティグのマニュアル編集：サンプルやコンティグエンドの削除、コンティグ分割 〇シーケンスアセンブリ 〇シーケンスアラインメント 〇シーケンストランスレーション 〇バーチャルクローニング 〇制限マッピング 〇RFLP 分析 〇プライマー設計 〇系統樹 〇突然変異の検出と分析 〇差分表 〇カスタマイズ 〇メチル化分析 □v13の新機能はこちら□ （ヒューリンクスのページへ） https://www.hulinks.co.jp/software/codoncode-aligner/codoncode-aligner-versions/

DNA 配列のアセンブリとアラインメント『CodonCode Aligner』新機能をご紹介します

バージョン 13 の新しい機能 ------------------------------------------- ■クローン検証 リードをクローンごとに素早くグループ化、リファレンスと照合して、その配列が想定したクローンと一致しているか確認できます。アラインメント上の全ての不一致箇所への直接リンクを記載したレポートが得られます。 ■NGSデータの変異検出 テキスト配列ファイル用の変異レポートを生成する新機能が追加されました。変異の解析にトレースファイルは不要、NGS プロジェクトにおける変異検出が可能になりました。 ■クローニング履歴機能 Aligner で作成した全てのクローニング構築物について、その作成過程の履歴が記録されるようになりました。 ■HiFi DNA アセンブリ HiFi DNA アセンブリのための仮想クローニング機能が導入されました。 □詳細はこちら□ （ヒューリンクスのページへ） https://www.hulinks.co.jp/software/codoncode-aligner/codoncode-aligner-versions/