分子高速アラインメントツール『FlexS』
リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolveIT社製ツール
『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの 投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を 高速に求めるツールです。 また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに 化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。 配置は、ファーマコフォアの投影点の一致(水素結合、イオン結合、疎水性相互作用)と vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。 【特長】 ■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う ■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う ■参照リガンドは剛体として評価 ■オプションモジュール:FlexS-C ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
基本情報
【対応プラットフォーム】 ■Windows ■Linux x86 32bit / 64bit ■MacOS X
価格帯
納期
用途/実績例
【用途】 ■3次元の分子の重ね合わせに ■3D-QSAR解析のための分子構造の前処理として ■共通母核構造・分子のミミック体の探索に ■リガンドベースのバーチャルスクリーニングの実行に ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。